現金輸送車が襲われ、2億6000万円を強奪する事件が発生。逃走した犯人グループは、車ごと激突したショッピングモールで人質50名をとり、そのまま立てこもるという暴挙に出る。事件発生から30時間が経過する中、警視庁捜査一課特殊捜査班（通称SIT）の宇佐木玲子（米倉涼子）が犯人との交渉に入った矢先、ショッピングモールが爆発。パニックで逃げ出す人質たち、マスコミや野次馬に紛れ、犯人の一味が逃走する。現場には主犯格と見られる男と、手付かずの現金だけが残された……。その数週間後、久々の休暇を取り、羽田空港にいた玲子は、先の事件で人質にとられていた青年・木元裕介（林遣都）を目撃する。彼の思いつめた様子に狂気を察知した玲子は、咄嗟に同じ便に潜り込むが、玲子の予感は的中。乗員・乗客合わせて159名を乗せた飛行機は、羽田を離陸した直後、ハイジャック犯に占拠されてしまう。高度10,000mの上空で、地上とのコンタクトが一切遮断された中、玲子と犯人たちとの熾烈な闘いが始まった……。