ルーカス・ニックルは、最近この町に越してきたばかりの気弱でシャイな10歳の男の子。転校生のルーカスは内気な性格のせいで中々友達が出来ない。そんな彼は近所のガキ大将からイジメの標的にされてしまう。ガキ大将に刃向かうことのできないルーカスは自分よりも小さくて弱い、庭のアリをいじめることでうっぷんを晴らしていた。そんなある日、ルーカスから仲間を守るため、アリの魔法使いゾックが立ち上がった。なんと魔法の薬でルーカスをアリサイズに縮めてしまったのだ。小さくなったルーカスは新たな世界を体験することになる。ルーカスとアリたちの不思議な共同生活が始まった。面倒見のいい姉御肌のアリ、ホーバがルーカスの世話係を買って出た。アリの生活をホーバに教わるルーカス。やがてアリたちとの生活を通して、ルーカスは友情やチームワークの大切さ、そして勇気を学んでいく。しかし、その頃、アリたちに最大の危機が訪れようとしていた……。