裏社会の掟を破り、粛清の包囲網から生還した伝説の殺し屋ジョン・ウィック(キアヌ・リーブス)。だが全てを牛耳る組織:主席連合から自由になるため、彼は動き始める。そんななか、組織内で権力を得た若き高官グラモン(ビル・スカルスガルド)は、聖域としてジョンを守ってきたニューヨークのコンチネンタルホテルを爆破。さらにジョンの旧友で盲目の達人ケイン(ドニー・イェン)を強引に引き入れ、ジョン・ウィック狩りに乗り出すのであった。一方、ジョンは大阪のコンチネンタルホテルを訪れ、ジョンの旧友にして支配人のシマヅ(真田広之)に協力を求める。果たしてジョンは、かつて忠誠を誓った裏の世界と決着をつけて、真の自由を手にすることができるのか……。