今から45年前。悪の秘密結社ショッカーの手によって改造人間となった1人の男がいた。その日から、人間の自由を守るために戦い続けてきたその男の名は、本郷猛(藤岡弘、)。この世に誕生した最初の仮面ライダーである。長年に渡って海外で悪と戦ってきた猛は、1人の少女の危機を知り、急遽帰国。少女の存在が、かつてのショッカー最高幹部・地獄大使(大杉漣)を復活させるために必要なのだ。猛は、仮面ライダーゴースト=天空寺タケル(西銘駿)や、その仲間たちと出会い、ショッカーが少女を狙う理由を探る。その一方で、あまりにも過酷な日々を過ごしてきた猛の肉体は、既に限界に近づいていた……。少女の危機、そして新たな組織ノバショッカーがもたらす日本最大の危機に、伝説の戦士・本郷猛が“変身”する。戦い続けてきた本郷猛を待つものは、安らぎか、それとも……?