父親を死から救うため悪魔と契約した男、ジョニー・ブレイズ（ニコラス・ケイジ）。同時に彼は、憎しみや怒りに呼応して、本人の意思とは関係なく、突然現れる復讐の妖精＝ゴーストライダーを自らの中に宿すことになった。炎に覆われたドクロ頭のダークヒーロー、ゴーストライダーは、バイクに跨って悪魔と戦うが、その存在は彼を苦しめていた。そんな折、ジョニーは光眼の僧侶モロー（イドリス・エルバ）からある依頼を受ける。それは、冥界・魔界の王メフィスト（キアラン・ハインズ）が自らの新たな体として狙っている運命の少年ダニー（ファーガス・リオーダン）を助けてほしいというものだった。憑りついた人間の身体が崩壊しつつあるメフィストは、予め契約によって人間の女性ナディア（ヴィオランテ・プラシド）に産ませたダニーの身体を狙っていたのだ。もしメフィストがダニーの身体を手に入れ、更なる力を得ることになれば、世界は悪の手に落ちてしまう。世界の危機を伝える一方でモローは、ダニーを助ければジョニーの呪いを解くと告げる。果たして、ジョニーはゴーストライダーが持つ闇の力をコントロールし、最強の敵からダニーを救い出すことができるのか……？さらに、自らにかけられた呪いを解くことができるのだろうか……？