世界各国が水面下で熾烈な情報戦を繰り広げていた時代。西国(ウェスタリス)の情報局対東課〈WISE〉の敏腕諜報員〈黄昏〉ことロイド・フォージャー（声：江口拓也）は、いつものように任務に当たっていると、進行中のオペレーション〈梟〉(ストリクス)の担当を変更するという指令が入る。ところが、新たな担当に選ばれたのは無能な男だった……。その頃イーデン校では、優勝者に〈星〉(ステラ)が授与されると噂の調理実習が実施されることに。少しでもオペレーション〈梟〉の進展を示し〈WISE〉へ任務継続を交渉するため、ひいては世界平和を守るため、ロイドは審査員長を務める校長の好物であるフリジス地方の伝統菓子≪メレメレ≫を作ることをアーニャ（声：種崎敦美）に提案。そこで本場の味を確かめるために、フォージャー家はフリジスへの家族旅行を計画する。そんななか、ヨル（声：早見沙織）は、出発前にロイドと謎の女のやりとりの一部始終を目撃、仮初めの関係に一抹の不安を覚えながらの家族旅行となってしまう……。旅行の途中、列車内でアーニャは怪しげなトランクケースを発見するが、その中にはなぜかチョコレートが入っていた。不思議に思っていると、トランクケースの持ち主が戻って来てしまい、驚いた拍子にアーニャは誤ってそのチョコレートを飲み込んでしまう。だが、そのチョコレートには世界平和を揺るがす重大な秘密が隠されていた。たたみかけるようにハプニングが続くなか、世界の命運はこの仮初めの家族に託されることになるが……。