その昔、テレビで超能力ブームが起こり、それを見ていた子供たちの中に特殊な能力を発動する者が現れ出した。その中には、後にサイキッカーZのリーダーとなるアキラ（中山雄介）の姿もあった。時は流れ、超能力に目覚めた子供たちは様々な能力を駆使して日本中で大活躍……などということはほとんどなく、大半は些細な能力であり、超能力で活躍できるのはほんの一握りであった。そんななか、アキラは自分と気が合う超能力者の仲間を集め、サイキッカーZというチームを結成する。協力して世のため人のために活動すべく、日々トレーニングや、YouTube配信でチームをアピールしたり、ライバル超能力チーム・ミスティックと競ったりしていた。そんなある日、突如謎の超能力者たちが現れ、アキラやその仲間たちを次々と襲い出し……。