ナスカ・ユニバーシティに進学したレイ（声：逢坂良太）、アンナ（声：瀬戸麻沙美）、タイラ（声：柿原徹也）、ハル（声：金元寿子）、エイスケ（声：羽多野渉）たちチーム・フューチャーの5人は、それぞれ夢を追いかけながら学生生活を送る一方で、宇宙からの侵略者レプタリアンと戦っている。しかしある時、タイラが邪悪な宇宙人ダハール（声：村瀬歩）の罠にかかり、行方がわからなくなってしまう。タイラを探すため、レイは3億3千万年前の地球へタイムジャンプ。その時代では、地球神アルファ（声：梅原裕一郎）が新たな文明の創造を計画、宇宙最強と言われるゼータ星の女帝ザムザ（声：千眼美子）率いるレプタリアンを地球に招き入れていた。そこへダハールが現れ……。