20世紀初頭。オスマン・トルコの小さな村で生まれ育ったアルメニア人青年のミカエル（オスカー・アイザック）は、医学を学ぶために首都イスタンブールの大学に入学する。そして彼は、フランス帰りのアルメニア人女性、アナ（シャルロット・ルボン）と出会い、惹かれ合うように。だがアナには、アメリカ人ジャーナリストの恋人クリス（クリスチャン・ベイル）がいた。やがて第一次世界大戦の勃発とともに、アルメニア人への弾圧が強まり、ミカエルは強制労働に送られてしまう。辛くも脱走したミカエルは故郷を訪れ、アルメニア人に対して虐殺が行われている現実を目の当たりにする。一方、クリスはトルコの蛮行を世界に訴えようと奔走。アナもクリスと行動を共にする。それぞれの信念の下、激動の時代を生き抜くミカエル、アナ、クリス。3人の愛の行方は？そして追い詰められたアルメニア人たちの運命は……？