地球外生命体を載せた宇宙探査機が地球に到達して16年が経ち、モンスターが蠢く危険地帯はメキシコから全世界に拡大していた。中東では、モンスターへの攻撃のために米軍が空爆を行い、巻き込まれた武装勢力との戦闘が激化する。モンスターという人類共通の脅威をよそに人間同士の戦争が果てしなく続くなか、新たに派兵された若き米兵たちに、危険地帯の深部で連絡を絶った部隊の救出という任務が下る。歴戦の英雄・フレイター軍曹（ジョニー・ハリス）に率いられ危険地帯の深部に踏み込んでいった彼らは、そこで未だかつてない巨大モンスターと遭遇する。激しい戦闘の果てに待ち受ける衝撃の真実とは？ そして、巨大モンスターの出現が人類にとって意味するものとは……？