地球連邦政府転覆の可能性を秘めた“ラプラスの箱”の在り処が遂に明らかになった。それは、全ての始まりの地であるスペースコロニー、インダストリアル7の巨大宇宙船“メガラニカ”だった。ビスト財団当主代行のマーサ・ビスト・カーバイン(声:塩田朋子)は、財団の権益を保持すべく、地球連邦政府中枢を担う移民問題評議会議長ローナン・マーセナス(声:小川真司)と、甥のアルベルト・ビスト(声:高木渉)を伴ってシャイアン基地に直行、事態の収拾を図ろうとする。一方、バナージ・リンクス(声:内山昂輝)は“ラプラスの箱”を奪取しようと先行したフル・フロンタル(声:池田秀一)を追ってインダストリアル7へ急ぐ。だがその前に、モビルスーツ、バンシィ・ノルンに搭乗したリディ・マーセナス(声:浪川大輔)と、アンジェロ・ザウパー(声:柿原徹也)のローゼン・ズールが立ち塞がる。“ラプラスの箱”の守り人、サイアムが待つメガラニカに到達する者は果たして誰なのか……?