横浜みなとみらいの街はプリキュアたちが、謎の怪物フュージョンを倒したというニュースで、もちきりだった。プリキュアに憧れる女の子たちは、ポーズをマネして大ハシャギ。そんな中、転校してきたばかりでひとりぼっちのあゆみは、学校の帰りに謎の生き物と出会う。あゆみはその子をフーちゃんと名づけ、ふたりはすっかり仲良しに。ところがフーちゃんは、闇の力をもつフュージョンのカケラで、友だちのいないあゆみのために、あゆみのキライなものをどんどん飲み込んで、学校や街をめちゃくちゃにするのだった。「こんなつもりじゃなかったのに……」あゆみの本当の気持ちを伝えるために、28人のプリキュアたちが大集結。皆の力がひとつになった時、奇跡の光が輝く……。