寡黙で孤独なサムライ・アフロ（声：サミュエル・L・ジャクソン）は、“一番”となる者は世界を制すると言われる闇の剣客道で頂点に君臨していた、父の仇・ジャスティスを倒した。その数年後、彼は今まで斬ってきた者たちの魂を供養するため、師範の道場に戻っていた。そこで彼は贖罪の日々を送り、仏像を彫り続けていた。しかし彼の前に、死んだはずの兄弟子で、クマのぬいぐるみを被った二刀流の剣客・仁之助と、謎の女・シヲ（ルーシー・リュー）が現れる。アフロへの復讐を訴える彼らの目的は、アフロの持つ“一番”のハチマキと父の遺骨だった。妖艶で冷血なシヲは自らを死刑執行人と呼び、哀しい過去の代償としてアフロに陰惨な死を与えようとする。アフロは再び復讐の輪廻に飲み込まれ、冷血無敵なサムライとして復活する。