1918年。芸術の都ウィーンの栄光は終焉を迎えようとしていた。絵画に新たな潮流を生み出した画家グスタフ・クリムト（ジョン・マルコヴィッチ）もまた、命の灯火を消そうとしていた。脳卒中で倒れ病院に運ばれた彼を見舞うのは、愛弟子のエゴン・シーレ（ニコライ・キンスキー）ただ一人。発作に苦しみ、朦朧とした意識の中、クリムトの目には、栄光と挫折の人生が蘇る……。1900年。保守的なウィーンでは、彼の描く裸の女性がスキャンダルとなった。対照的にパリでは絶賛され、パリ万博で金賞を受賞する。その会場でスクリーンに映る美しい女性レア（サフラン・バロウズ）に心奪われたクリムトは、嫉妬する恋人ミディ（ヴェロニカ・フェレ）を放っておき文化省の書記官（スティーヴン・ディレイン）の計らいでレアと密会を果たし、彼女の肖像画の依頼を受ける。ウィーンに戻ったクリムトは、大臣から助成金を打ち切られたことを聞き、ますます反抗的になる。そんなとき、クリムトのモデルをしていたミッツィ（アグライア・シスコヴィチ）が彼の子どもを産んだと聞き、会いに行く。彼にはモデルたちとの間に、すでにたくさんの子どもがいたのだ。ミディにプラトニックな愛を求め、モデルたちに肉体的な愛を求めるクリムト。しかし彼の魂が求めるのは、宿命の女レアだけだ。書記官にレアと会うことを促され、彼女の居場所を教えられる。しかし、周囲の人には書記官の姿は見えず、クリムトの独り言にしか見えない。謎の書記官はクリムトのもう一人の自分、心の声だったのだ。心の声に導かれるままに、彼はレアの庇護者である公爵（ポール・ヒルトン）に会いに行く。しかし公爵はレアは死んだと告げる。虚構と現実が入り交じり、パラノイアは深まる。クリムトは混沌とした意識で、自分の世界を彷徨うのだった。