ポール（グレッグ・キニア）とジェシー（レベッカ・ローミン）は、愛息アダム（キャメロン・ブライト）と幸せな生活を送っていた。しかしアダムは不運にも交通事故に巻き込まれて死んでしまう。悲嘆にくれるポールらの前に遺伝子学者ウェルズ博士（ロバート・デ・ニーロ）が現れた。ウェルズはヒトクローン創造の可能性を説き、アダムを再生させないかと持ちかけた。アダムへの愛情から夫妻はウェルズの提案を受け入れてしまう。こうして第二のアダムが生まれた。すくすく成長していくアダム。しかし次第に様子がおかしくなってくる。不気味な絵を描いたり汚い言葉を吐いたり、一方では悪夢や幻覚を見るようになっていたのだ。不可解に思ったポールは独自に調査を進め、アダムの悪夢に出てくる凶暴な少年「ザカリー」が実際に存在したことを突き止めた。ザカリーは母親を殺し、家に火を放ったという悪魔のような少年だった。そしてザカリーの父親こそウェルズであり、アダムのクローンを作るときにザカリーの細胞の一部を使用したことが判明する。ザカリーが母親を殺したように、アダムもまた、母ジェシーの頭部にハンマーを振り下ろそうとしていた……。