舞台ははるか未来の西暦2131年、世界を壊滅状態に追い込んだ非核大戦直後の時代。荒廃の中で人類が手にした最後の理想郷、そこはオリュンポスと呼ばれていた。その人口の50％は、ヒト社会の安定を目的として造られたクローン人間＜バイオロイド＞だった。大戦を生き抜いた若き有能な女性兵士、デュナン・ナッツ（声：小林愛）はある日突然捕獲され、”オリュンポス”に連行される。目を覚ましたデュナンの前には、かつての恋人プリアレオス（小杉十郎太）がいた。しかし彼は、北アフリカ戦線で生死の境をさまようほどの重傷を負い、結果、体の大半が機械化されていた。元恋人の変わり果てた姿に、言葉を失うデュナン。しかしその驚愕を超える”オリュンポスの真実”に、デュナンとプリアレオスの運命は巻き込まれてゆく。