1942年、第二次世界大戦下のオランダはアムステルダム。ここにもナチスの侵略の手は伸び、そこに暮らすユダヤ系の人たちはいつ呼び出されるやも知れぬ反ユダヤ政策（ユダヤ人狩り）の恐怖に脅えていた。13歳の少女アンネ・フランク一家も、そんな一家族だった。7月、ついにフランク一家にナチスからの“呼び出し”がかかった。だが、アンネの父・オットーは、そんなことでおめおめ命を無駄にするような人物ではなかった。彼はあらかじめ用意してあった“隠れ家”へ家族を伴って移り住む。そこは友人ミープの働く事務所の上にある隠し部屋。彼らの食料などの世話はミープによって賄われたが、日中は他の事務員にも気づかれぬよう、物音ひとつ立てられない不便な生活を強いられてしまう。しかしそんな状況下にあっても、アンネは両親から誕生日に貰った日記帳に“キティ”という名前を付け、日々の悩み、苦しみや怒り、そして希望を書き綴ることで、明るさを失わずに過ごすのであった。ある日、その隠れ家にファンダーン一家と、歯医者のデュッセルが加わる。8人の共同生活は、時に明るく楽しく、時に絶望に沈むこともあったが、そこで2度目の新年を迎えた春、彼らは連合軍によるノルマンディー上陸作戦のニュースを聞き、“解放”の日が近いことに胸を躍らせる。その間にアンネも初潮を迎え、ファンダーンの息子ペーターとのほのかな恋心を抱くようになっていた。ところが44年の8月、彼らの隠れ家はナチスの知るところとなり、ついに8人全員連行されてしまうのであった。オットー・フランクを除いたアンネたちはそれぞれの収容所で、その生涯を閉じる。