ある日突然、のび太（大原めぐみ）の部屋の畳が跳ね上がる。驚いたドラえもん（水田わさび）とのび太が覗き込むと、そこは何と、遥か宇宙の彼方を航海する宇宙船につながっていた。超空間のねじれが原因らしい。宇宙船を操縦しているのは、ロップルと宇宙ウサギのチャミー。ロップルたちは、“コーヤコーヤ星”という星に移り住み、開拓している途中だった。コーヤコーヤ星は、豊かな自然と不思議な動物たちでいっぱいの星。ドラえもんとのび太はロップルたちと仲良くなるが、この資源豊かな星を狙うガルタイト鉱業一味は、ある恐るべき作戦を企てていた。ドラえもんとのび太たちは、コーヤコーヤ星を、ロップルたちを守れるのか!?